MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2011585232 · doi:10.1139/b04-059

Ultrastructure of the<i>Aspergillus nidulans hypA1</i>restrictive phenotype shows defects in endomembrane arrays and polarized wall deposition

2004· article· en· W2011585232 sur OpenAlexvenueno aff
Susan G. W. Kaminskyj, Melissa R Boire

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Botany · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueFungal and yeast genetics research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésEndomembrane systemAspergillus nidulansHyphaWild typeBiologyCell wallCytoplasmCell biologyUltrastructureMutantVacuoleGolgi apparatusMicrobiologyGeneBiochemistryBotanyEndoplasmic reticulum

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Aspergillus nidulans Eidam (G. Wint.) wild-type hyphal morphogenesis requires the hypA gene product. Like its homolog in Saccharomyces cerevisiae Meyen ex E.C. Hansen, TRS120, hypA encodes a cytoplasmic protein likely associated with endomem branes. hypA is not essential, but hypA1 temperature-sensitive strains grow poorly at restrictive temperatures. In younger cells, endomembrane arrays were aberrant, only sometimes resembling wild type. In older cells, Golgi equivalents were swollen, impacted with electron-dense granules. In hypA1 strains grown at 42 °C, the poorly polarized hyphae lack recognizable Spitzenkörper and have walls at least four-fold thicker than those of wild-type or hypA1 strains grown at 28 °C. At restrictive temperatures, both hyphal width and wall thickness increase markedly in basal regions, suggesting wall deposition is impaired. Septa are thicker than in wild type, but have medial pores and Woronin bodies. Individual nuclei and mitochondria are smaller at 42 °C than at 28 °C, but each collectively occupies similar proportions of the cytoplasm. Mitochondrial cristae are reduced in number and width at 42 °C, possibly compromising metabolic efficiency; in older cells, cristae are widely spaced and randomly inserted. If hypA1 cells grown at 42 °C are shifted to 28 °C, the thickened wall is precisely degraded for growth of wild-type branches, which form within 1 h, suggesting areas of nascent polarity formed at 42 °C require the hypA product for wild-type function.Key words: endomembrane, filamentous fungus, electron microscopy, cell wall, secretion, Saccharomyces TRS120.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,201
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCanadian Journal of BotanyMême sujetFungal and yeast genetics researchTravaux en français237 207