MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2011660173 · doi:10.1111/j.1574-6968.2009.01625.x

The presence of a 1-aminocyclopropane-1-carboxylate (ACC) deaminase deletion mutation alters the physiology of the endophytic plant growth-promoting bacterium<i>Burkholderia phytofirmans</i>PsJN

2009· article· en· W2011660173 sur OpenAlexafffund
Yili Sun, Zhenyu Cheng, Bernard R. Glick

Notice bibliographique

RevueFEMS Microbiology Letters · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyrpoSMutantSiderophoreMicrobiologyBurkholderiaBacteriaBiochemistryGeneGene expressionGeneticsPromoter

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The structural gene for 1-aminocyclopropane-1-carboxylate (ACC) deaminase (acdS) from the endophytic plant growth-promoting bacterium Burkholderia phytofirmans PsJN was isolated and used to construct a mutant strain B. phytofirmans YS2 (B. phytofirmans PsJN/Delta acdS), in which an internal segment of the acdS gene was deleted. The mutant YS2 lost ACC deaminase activity as well as the ability to promote the elongation of the roots of canola seedlings. Concomitant with the creation of this deletion mutant, a number of physiological changes were observed in the bacterium, including an increase in indole acetic acid synthesis, a decrease in the production of siderophores and an increase in the cellular level of the stationary-phase sigma factor, RpoS. Introduction of the wild-type acdS gene into the mutant YS2 to construct strain B. phytofirmans YS3 (B. phytofirmans YS2/pRK-AcdS) restored both ACC deaminase activity and plant growth-promotion activity in strain YS3. However, the complemented mutant still showed the above-mentioned physiological changes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,189
Écart entre enseignants0,180 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations217
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueFEMS Microbiology LettersMême sujetPlant-Microbe Interactions and ImmunityTravaux en français237 207