Emergence of New CMRSA7/USA400 Methicillin-Resistant Staphylococcus aureus <i>spa</i> Types in Alberta, Canada, from 2005 to 2012
Notice bibliographique
Résumé
Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) has become one of the most significant pathogens affecting global public health and health care systems. In Canada and the United States, the spread of MRSA is primarily attributed to a single dominant epidemic clone: CMRSA10/USA300. Despite this, the CMRSA7/USA400 epidemic clone has been reported to be the predominate epidemic clone in several Canadian provinces and some parts of the United States. This study examined the epidemiology of CMRSA7/USA400 MRSA in Alberta, Canada, from June 2005 to December 2012. Molecular characterization of CMRSA7/USA400 isolates was done using spa, SCCmec, PVL, and PFGE typing and identified two predominant spa types in Alberta: t128 and t1787. Although closely related, these spa types have distinct geographic distributions. From 2010 to 2012, the number of t128 infections has remained stable while there has been a nearly 3-fold increase in the number of provincial t1787 infections, accompanied by 10-fold increases in t1787 infection rates in some communities. Most t128 and t1787 patients were First Nations or Inuit people, and isolates were usually from skin and soft tissue infections in outpatients. t128 patients were significantly older than t1787 patients. Antimicrobial susceptibility testing showed higher mupirocin resistance in t1787 than in t128 MRSA. Improved strategies to reduce or stabilize t1787 infections in Alberta are needed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».