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Enregistrement W2012508686 · doi:10.1042/bj20140931

Red fluorescent genetically encoded Ca2+ indicators for use in mitochondria and endoplasmic reticulum

2014· article· en· W2012508686 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensLibin Cardiovascular Institute of AlbertaUniversity of CalgaryUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNational Institute of Neurological Disorders and StrokeBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilWellcome Trust
Mots-clésEndoplasmic reticulumCytoplasmIntracellularMitochondrionGreen fluorescent proteinCell biologyCalcium signalingFluorescenceExtracellularBiochemistryBiologyBiophysicsLive cell imagingChemistryCellGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ca2+ is a key intermediary in a variety of signalling pathways and undergoes dynamic changes in its cytoplasmic concentration due to release from stores within the endoplasmic reticulum (ER) and influx from the extracellular environment. In addition to regulating cytoplasmic Ca2+ signals, these responses also affect the concentration of Ca2+ within the ER and mitochondria. Single fluorescent protein-based Ca2+ indicators, such as the GCaMP series based on GFP, are powerful tools for imaging changes in the concentration of Ca2+ associated with intracellular signalling pathways. Most GCaMP-type indicators have dissociation constants (Kd) for Ca2+ in the high nanomolar to low micromolar range and are therefore optimal for measuring cytoplasmic [Ca2+], but poorly suited for use in mitochondria and ER where [Ca2+] can reach concentrations of several hundred micromolar. We now report GCaMP-type low-affinity red fluorescent genetically encoded Ca2+ indicators for optical imaging (LAR-GECO), engineered to have Kd values of 24 μM (LAR-GECO1) and 12 μM (LAR-GECO1.2). We demonstrate that these indicators can be used to image mitochondrial and ER Ca2+ dynamics in several cell types. In addition, we perform two-colour imaging of intracellular Ca2+ dynamics in cells expressing both cytoplasmic GCaMP and ER-targeted LAR-GECO1. The development of these low-affinity intensiometric red fluorescent Ca2+ indicators enables monitoring of ER and mitochondrial Ca2+ in combination with GFP-based reporters.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,058
Score d'incertitude au seuil0,669

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle