A Sequence Specific PCR Marker for Distinguishing Rice Lines on the Basis of Wild Abortive Cytoplasm from Their Cognate Maintainer Lines
Notice bibliographique
Résumé
Ensuring the genetic purity of parental lines and hybrids is a prerequisite to realize their full potential. The cytoplasmic male sterile (CMS) lines that are utilized for developing the popular “three‐line” hybrids, often get contaminated with their isonuclear maintainer lines during CMS line multiplication. Use of such CMS lines in hybrid seed production results in the production of genetically impure hybrid seed. We report the identification of a DNA sequence that is homologous to rice mitochondrial DNA but unique to the Wild Abortive (WA) cytoplasmic male sterile lines of rice (Oryza sativa L.). In a polymerase chain reaction (PCR) using total genomic DNA as a template, oligonucleotide primers based on this unique DNA sequence could amplify a fragment from CMS lines of rice and their hybrids but not from their cognate maintainer lines. In tests on mixed samples of plants containing both CMS and Maintainer lines, this PCR assay was used to correctly predict the genotypes of these plants indicating that it can be used to detect the mixture of maintainer lines in the seed stocks of the CMS line.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».