The Cellular Retinol-Binding Protein Genes Are Duplicated and Differentially Transcribed in the Developing and Adult Zebrafish (Danio rerio)
Notice bibliographique
Résumé
There are single copies of the genes encoding the cellular retinol-binding protein type I and II (CRBPI and CRBPII) in the human and rodent genomes. We have identified duplicate genes for both CRBPI and CRBPII in the zebrafish (Danio rerio) genome (rbp1b and rbp2b). The zebrafish rbp1b and rbp2b have conserved gene structures, amino acid sequence similarities, gene phylogenies, and syntenic relationships with their mammalian orthologs and zebrafish paralogs, rbp1a and rbp2a. Like the mammalian genes for CRBPI and CRBPII, the zebrafish rbp1b and rbp2b genes are closely linked on a single linkage group. Comparative analysis suggests that the duplicate genes of rbp1 and rbp2 in the zebrafish genome may have arisen by chromosomal or whole-genome duplication. During embryonic development, rbp1b transcripts were detected in the gall bladder of 5-day postfertilization (5 dpf) larvae. The rbp2b mRNA was abundant in the developing liver through 48 hours postfertilization (48 hpf) to 5 dpf. Using reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR), rbp1b transcripts were detected in the ovary, and rbp2b mRNA was observed predominantly in the adult liver. Tissue section in situ hybridization and emulsion autoradiography localized rbp1b mRNA to primary oocytes within the zebrafish ovary. The differential mRNA distribution patterns of the rbp1a, rbp1b, rbp2a, and rbp2b genes in the developing and adult zebrafish suggest that shuffling of subfunctions among duplicate copies of paralogous genes may be a mechanism for the retention of duplicated genes in vertebrates.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».