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Enregistrement W2014354522 · doi:10.1002/jcb.21832

Association of Sp3 and estrogen receptor α with the transcriptionally active trefoil factor 1 promoter in MCF‐7 breast cancer cells

2008· article· en· W2014354522 sur OpenAlexafffund
Lin Li, James Davie

Notice bibliographique

RevueJournal of Cellular Biochemistry · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer-related gene regulation
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCancerCare Manitoba Foundation
Mots-clésEstrogen receptorRNA polymerase IIMolecular biologyEstrogen receptor betaPromoterEstrogen receptor alphaEstrogenChromatin immunoprecipitationSp1 transcription factorCancer researchTranscription factorBiologyChemistryGene expressionGeneEndocrinologyCancerBreast cancerBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To further explore the role of Sp1 and Sp3 in the estrogen regulated TFF1 gene transcription, chromatin immunoprecipitation (ChIP) assay was used to determine the association of estrogen receptor alpha (ERalpha), Sp1 and Sp3 with the endogenous trefoil factor 1 (TFF1) gene promoter in MCF-7 breast cancer cells. ERalpha and serine 5 phosphorylated RNA polymerase II, the form of RNA polymerase II associated with transcription initiation, were recruited to the TFF1 gene promoter following estrogen addition to MCF-7 cells cultured under estrogen deplete conditions. Both Sp1 and Sp3 were bound to the TFF1 gene promoter before and after estrogen treatment. Using the re-ChIP assay, we demonstrate that either Sp1 or Sp3 but not both bind to a TFF1 promoter. The co-occupancy of ERalpha and Sp1 on TFF1 promoter remains at similar level with and without estrogen, while that of ERalpha and Sp3 increased in the presence of estrogen. Further, we observed increased co-occupancy of Sp3 and serine 5 phosphorylated RNA polymerase II on the TFF1 promoter after estrogen treatment of cells. Taken together, these results provide evidence that Sp3 and ERalpha are involved in the estrogen induced transcription of the TFF1 gene.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,386

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,004
Tête enseignante GPT0,194
Écart entre enseignants0,190 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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