Proposal to transfer ‘ <i>Aegyptianella ranarum</i> ’, an intracellular bacterium of frog red blood cells, to the family Flavobacteriaceae as ‘ <i>Candidatus</i> Hemobacterium ranarum’ comb. nov.
Notice bibliographique
Résumé
'Aegyptianella ranarum' (order Rickettsiales), an ultrastructurally defined small, Gram-negative rod, is known to replicate in the red blood cells of frogs. Heretofore, this bacterium has not been characterized genetically. We cloned and sequenced the 16S rRNA (1310 bp) and gyrB (718 bp) genes of 'A. ranarum' from a Canadian frog blood specimen. In situ hybridization (with an 'A. ranarum' 16S rRNA gene polymerase chain reaction product as probe) and electron microscopy confirmed that 'A. ranarum' forms cytoplasmic inclusions in frog erythrocytes. blast comparisons with GenBank 16S rRNA and gyrB sequences showed that both 'A. ranarum' genes were most similar (91% and 67% identity) to those of Chryseobacterium meningosepticum, a bacterium in the family Flavobacteriaceae. In contrast, 'A. ranarum' 16S rRNA shared only 61% identity with Aegyptianella pullorum. Phylogenetic analyses of these genes using phylip supported 'A. ranarum' as a member of Flavobacteriaceae, but suggested that its cladistic sibling may be Bergeyella zoohelcum or Weeksella virosa, rather than C. meningosepticum. We propose to classify 'Aegyptianella ranarum' as 'Candidatus Hemobacterium ranarum' in the family Flavobacteriaceae. Our results provide a starting point for studies of related intraerythrocytic bacterial infections in frogs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».