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Enregistrement W2014979109 · doi:10.1159/000126518

Tissue-Specific and Substrate-Specific Endoproteolytic Cleavage of Monkey Pro-Opiomelanocortin in Heterologous Endocrine Cells: Processing at Lys-Lys Dibasic Pairs

2008· article· en· W2014979109 sur OpenAlexaff
Hsia-lien Lin, Nicola C. Day, Yasuko Ueda, Jack E. Dixon, Donald Martin, Nabil G. Seidah, Huda Akil

Notice bibliographique

RevueNeuroendocrinology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueRegulation of Appetite and Obesity
Établissements canadiensUniversité de MontréalMontreal Clinical Research Institute
Organismes subventionnairesNational Institute on Drug AbuseNational Institutes of Health
Mots-clésCleavage (geology)FurinHeterologousComplementary DNABiologyHeterologous expressionMutantCell cultureBiochemistryMolecular biologyChemistryCell biologyRecombinant DNAEnzymeGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This study compares the processing of pro-opiomelanocortin (POMC) at two Lys-Lys cleavage sites, located in the carboxy-terminal domain of the precursor, one site marking the amino terminus of beta-melanocyte-stimulating hormone (beta-MSH) and the other in the carboxy-terminus of beta-endorphin (beta E). These comparisons were carried out by transfecting monkey POMC cDNA into two heterologous cell lines: AtT-20, which endogenously expresses mouse POMC, and Rin m5F, which has been previously used as a host for transfected POMC. These cells lines are known to process POMC differently at Lys-Arg residues, though less is known about their Lys-Lys cleavage. Our results have demonstrated both tissue-specific and site-specific factors controlling Lys-Lys cleavage. The AtT-20 line appears not to perform either Lys-Lys cleavage. Rin m5F cells, on the other hand, fail to process the site at the carboxy terminus of beta E (beta E28-29) but do process, to a significant extent, the N-terminal site to beta-MSH. That this differential processing is unlikely to be due to a POMC conformation which would make the beta E site inaccessible was demonstrated by mutating the sites from Lys-Lys to Lys-Arg. With such mutants, Rin m5F cells fully processed at both locations. Interestingly, the mutant Lys-Arg sites were not fully processed by AtT-20 cells. These results are discussed in terms of the complement of processing enzymes expressed in each of the cell lines, as well as the role of residues surrounding the diabasic cleavage sites in determining the likelihood of proteolysis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,065
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,045
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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