The effect of genotype and in utero environment on interindividual variation in neonate DNA methylomes
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Integrating the genotype with epigenetic marks holds the promise of better understanding the biology that underlies the complex interactions of inherited and environmental components that define the developmental origins of a range of disorders. The quality of the in utero environment significantly influences health over the lifecourse. Epigenetics, and in particular DNA methylation marks, have been postulated as a mechanism for the enduring effects of the prenatal environment. Accordingly, neonate methylomes contain molecular memory of the individual in utero experience. However, interindividual variation in methylation can also be a consequence of DNA sequence polymorphisms that result in methylation quantitative trait loci (methQTLs) and, potentially, the interaction between fixed genetic variation and environmental influences. We surveyed the genotypes and DNA methylomes of 237 neonates and found 1423 punctuate regions of the methylome that were highly variable across individuals, termed variably methylated regions (VMRs), against a backdrop of homogeneity. MethQTLs were readily detected in neonatal methylomes, and genotype alone best explained ∼25% of the VMRs. We found that the best explanation for 75% of VMRs was the interaction of genotype with different in utero environments, including maternal smoking, maternal depression, maternal BMI, infant birth weight, gestational age, and birth order. Our study sheds new light on the complex relationship between biological inheritance as represented by genotype and individual prenatal experience and suggests the importance of considering both fixed genetic variation and environmental factors in interpreting epigenetic variation.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,003 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle