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Enregistrement W2015673931 · doi:10.1093/molbev/msg193

Sex-Linked Mammalian Sperm Proteins Evolve Faster Than Autosomal Ones

2003· article· en· W2015673931 sur OpenAlexaff
Dara G. Torgerson

Notice bibliographique

RevueMolecular Biology and Evolution · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and Clinical Aspects of Sex Determination and Chromosomal Abnormalities
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésNonsynonymous substitutionBiologyAutosomeGeneticsSpermX chromosomeGeneMutation rateMutationChromosomeY chromosomeAlleleGenome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

X-linked genes can evolve slower or faster depending on whether most recessive, or at least partially recessive alleles are deleterious or beneficial due to their hemizygous expression in males. Molecular studies of X chromosome divergence have provided conflicting evidence for both a higher and lower rate of nucleotide substitution at both synonymous and nonsynonymous sites, depending on the nucleotide sites sampled. Using human and mouse orthologous genes, we tested the hypothesis that genes encoding male-specific sperm proteins are evolving faster on the X chromosome compared with autosomes. X-linked sperm proteins have an average nonsynonymous mutation rate almost twice as high as sperm genes found on autosomes, unlike other tissue-specific genes, where no significant difference in the nonsynonymous mutation rate between the X chromosome and autosomes was found. However, no difference was found in the average synonymous mutation rate of X-linked versus autosomal sperm proteins, which along with corresponding higher values of Ka/Ks in X-linked sperm proteins suggest that differences in selective forces and not mutation rates are the underlying cause of higher X-linked mammalian sperm protein divergence.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,159
Score d'incertitude au seuil0,746

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,245 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations88
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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