Identification of a Novel Apolipoprotein(a)-related Protein from the European Hedgehog ( Erinaceus europaeus )
Notice bibliographique
Résumé
We have isolated a cDNA encoding an apo(a)-related protein designated HaRP-1 (Hedgehog apo(a) related protein-1). The HaRP-1 cDNA (2114 bp; corresponding to a 2.6 kb transcript) was isolated from a hedgehog liver cDNA library. The HaRP-1 clone corresponded to an open reading frame of 676 amino acids and contains a signal sequence followed by a preactivation domain and 7 kringle domains which exhibit an average of 57% amino acid identity with hedgehog plasminogen kringle III. We expressed HaRP-1 in human embryonic kidney cells; immunoprecipitation of metabolically-labeled conditioned medium from transfected cells showed the presence of a 74 kDa band corresponding to HaRP-1. Of note, we also observed an approximately 72 kDa species present in hedgehog plasma by western blotting using a human anti-apo(a) monoclonal antibody; we speculate that the 72 kDa plasma species corresponds to HaRP-1. Interestingly, although none of the 7 kringle domains contained a canonical lysine-binding site, we found that recombinant HaRP-1 bound specifically to lysine-Sepharose. It is likely that the evolution of the HaRP-1 gene is coincident with the evolution of hedgehog apo(a), both of which occurred by duplication of the plasminogen kringle III motif. The function of HaRP-1 remains unclear at present, but may constititute a member of the family of apo(a) proteins that functions in the regulation of lysine-dependent proteolysis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».