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Enregistrement W2015692680 · doi:10.1080/1042517021000050642

Identification of a Novel Apolipoprotein(a)-related Protein from the European Hedgehog ( Erinaceus europaeus )

2003· article· en· W2015692680 sur OpenAlexaff
Andrea R. Belczewski, P M Laplaud, M. John Chapman, Santica M. Marcovina, Marlys L. Koschinsky

Notice bibliographique

RevueDNA sequence · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueHedgehog Signaling Pathway Studies
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesNational Heart, Lung, and Blood InstituteInstitut National de la Recherche Agronomique
Mots-clésBiologyHedgehogMolecular biologyComplementary DNAPeptide sequenceImmunoprecipitationcDNA libraryBiochemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have isolated a cDNA encoding an apo(a)-related protein designated HaRP-1 (Hedgehog apo(a) related protein-1). The HaRP-1 cDNA (2114 bp; corresponding to a 2.6 kb transcript) was isolated from a hedgehog liver cDNA library. The HaRP-1 clone corresponded to an open reading frame of 676 amino acids and contains a signal sequence followed by a preactivation domain and 7 kringle domains which exhibit an average of 57% amino acid identity with hedgehog plasminogen kringle III. We expressed HaRP-1 in human embryonic kidney cells; immunoprecipitation of metabolically-labeled conditioned medium from transfected cells showed the presence of a 74 kDa band corresponding to HaRP-1. Of note, we also observed an approximately 72 kDa species present in hedgehog plasma by western blotting using a human anti-apo(a) monoclonal antibody; we speculate that the 72 kDa plasma species corresponds to HaRP-1. Interestingly, although none of the 7 kringle domains contained a canonical lysine-binding site, we found that recombinant HaRP-1 bound specifically to lysine-Sepharose. It is likely that the evolution of the HaRP-1 gene is coincident with the evolution of hedgehog apo(a), both of which occurred by duplication of the plasminogen kringle III motif. The function of HaRP-1 remains unclear at present, but may constititute a member of the family of apo(a) proteins that functions in the regulation of lysine-dependent proteolysis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,008
Score d'incertitude au seuil0,549

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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