Identification of a Novel Apolipoprotein(a)-related Protein from the European Hedgehog ( Erinaceus europaeus )
Notice bibliographique
Résumé
We have isolated a cDNA encoding an apo(a)-related protein designated HaRP-1 (Hedgehog apo(a) related protein-1). The HaRP-1 cDNA (2114 bp; corresponding to a 2.6 kb transcript) was isolated from a hedgehog liver cDNA library. The HaRP-1 clone corresponded to an open reading frame of 676 amino acids and contains a signal sequence followed by a preactivation domain and 7 kringle domains which exhibit an average of 57% amino acid identity with hedgehog plasminogen kringle III. We expressed HaRP-1 in human embryonic kidney cells; immunoprecipitation of metabolically-labeled conditioned medium from transfected cells showed the presence of a 74 kDa band corresponding to HaRP-1. Of note, we also observed an approximately 72 kDa species present in hedgehog plasma by western blotting using a human anti-apo(a) monoclonal antibody; we speculate that the 72 kDa plasma species corresponds to HaRP-1. Interestingly, although none of the 7 kringle domains contained a canonical lysine-binding site, we found that recombinant HaRP-1 bound specifically to lysine-Sepharose. It is likely that the evolution of the HaRP-1 gene is coincident with the evolution of hedgehog apo(a), both of which occurred by duplication of the plasminogen kringle III motif. The function of HaRP-1 remains unclear at present, but may constititute a member of the family of apo(a) proteins that functions in the regulation of lysine-dependent proteolysis.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».