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Enregistrement W2015761532 · doi:10.1094/pdis-91-9-1202a

<i>Potato aucuba mosaic virus</i> in Potato in New York State

2007· article· en· W2015761532 sur OpenAlexaboutno aff
James Susaimuthu, Bright Agindotan, Laurie A. Miller, Keith L. Perry

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyPotato virus YGenBankPlant virusSolanum tuberosumTobacco mosaic virusVirusInoculationHorticulturePotato virus XPotyvirusVirologyBotanyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Solanum tuberosum cv. Elmer's Blue is one of a number of heritage potato accessions maintained at Cornell University that exhibit virus-like symptoms of stunting and a leaf yellowing or a mottle mosaic. Testing of this cultivar by double-antibody sandwich (DAS)-ELISA revealed that it was infected with Potato virus S (PVS) but none of the other common potato viruses screened for in North American potato certification programs (3). Mechanical inoculation of sap from potato cv. Elmer's Blue onto Nicotiana debneyii, N. megalosiphon, N. occidentalis, and N. tabacum produced a range of yellowing and mosaic symptoms (symptomless on N. tabacum), indicating the presence of a transmissible agent, but all these hosts tested negative for PVS. To identify possible viruses, reverse transcription (RT)-PCR assays involving generic primers for different groups of viruses were performed on the potato and the Nicotiana spp. Degenerate primers specific to members of the genus Potexvirus (4) amplified a 600-bp region from the symptomatic potato and N. debneyii. Nucleotide sequencing of the RT-PCR amplified product from potato cv. Elmer's Blue (Genbank Accession No. EF609120) and comparisons with GenBank sequences revealed the amplified sequence as having 91% identity with the genomic sequence of Potato aucuba mosaic virus (PAMV; Accession No. S73580). The presence of this virus in potato cv. Elmer's Blue and N. debneyii was confirmed by PAMV-specific antibodies (Agdia, Inc., Elkhart, IN) in a DAS-ELISA format. PAMV is reported to occur worldwide, but uncommonly, with most descriptive work from Europe (2). While this virus has been studied in North America (1,2), these reports employed virus stocks from Europe under experimental conditions or virus in tubers obtained directly from Europe; to our knowledge, there are no unambiguous reports of PAMV in naturally infected North American potato cultivars. By contrast, the PAMV-infected cultivar in this report is a selection originally from a Canadian grower, and although not grown commercially, it is maintained in garden and field plots in New York and other states. References: (1) R. H. Bagnall. Phytopathology 50:460, 1960. (2) G. F. Kollmer and R. H. Larson. Res. Bull. Agric. Exp. Stn. Univ. Wis. 223:1, 1960. (3) S. A. Slack. Page 61 in: Potato Health Management. The American Phytopathological Society. St. Paul, MN, 1993. (4) R. A. A. van der Vlugt and M. Berendsen. Eur. J. Plant Pathol. 108:367, 2002.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,362
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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