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Enregistrement W2016017164 · doi:10.1021/ja805801j

Enzyme-like Acceleration for the Hydrolysis of a DNA Model Promoted by a Dinuclear Zn(II) Catalyst in Dilute Aqueous Ethanol

2008· article· en· W2016017164 sur OpenAlexaff
C. Tony Liu, Alexei A. Neverov, R. S. Brown

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Chemical Society · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA and Nucleic Acid Chemistry
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryCatalysisEthanolReaction rate constantAqueous solutionHydrolysisPhosphoric acidDissociation constantInorganic chemistryAlcoholKineticsSolventNuclear chemistryMedicinal chemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The rates and products of cleavage of methyl (2-chloro-4-nitrophenyl) phosphate (2) promoted by a dinuclear Zn(II) complex (3) of 1,3-bis-N,N'(1,5,9-triazacyclododecyl)propane along with 1 equiv of ethoxide were investigated in ethanol solution containing small amounts of water (8 mM <or= [H2O] <or= 2.1 M) at 25 degreesC and sspH 7.9. The kinetics of decomposition of 5 x 10(-5) M 2 in the presence of varying [3] (0.03 mM <or= [3] <or= 0.12 mM) in ethanol containing 28 mM water show very strong saturation binding which is analyzed to give fitted values for the complex dissociation constant (Kd) and maximum catalytic rate constant (kcatmax) of 3.2 x 10(-8) M and 1.47 x 10(-3) s(-1). Product analysis indicates that the reaction in ethanol containing 28 mM and 2.1 M water produces 46% and 93% of the hydrolysis product (methyl phosphoric acid), with the remainder being ethanolysis product (ethyl methyl phosphate). Analysis of the kinetics of the reaction at 28 mM water indicates that second order rate constant for the catalytic reaction, given as kcatmax/Kd, is 4.6 x 104 M(-1) s(-1), is a factor of 8.4 x 10(10) larger than the second order rate constant (k2EtO) for the ethoxide promoted reaction of 2 in ethanol (5.5 +/- 0.3) x 10(-7) M(-1) s(-1). A more detailed analysis that considers the relative acidities of water and ethanol in ethanol solvent indicates that at sspH 7.9, the ethanolysis is accelerated by 2.3 x 10(14) times relative to the computed ethoxide reaction at that sspH, while the hydrolysis is accelerated by >or=1.6 x 10(17) times relative to the background hydroxide reaction, suggesting that complex 3 promotes the hydrolysis at least 1000 times more effectively than ethanolysis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,345

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,232
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations29
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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