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Enregistrement W2016255587 · doi:10.1139/x06-112

Post hoc blocking to improve heritability and precision of best linear unbiased genetic predictions

2006· article· en· W2016255587 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

venuePublié dans une revue dont le pays d'attache est le Canada.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Forest Research · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineDecision Sciences
ThématiqueOptimal Experimental Design Methods
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBlocking (statistics)StatisticsHeritabilityBlock designPost hocBlock (permutation group theory)MathematicsPost-hoc analysisRandomized block designSelection (genetic algorithm)Block sizeComputer scienceBiologyCombinatoricsEcologyGeneticsMedicineArtificial intelligenceKey (lock)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Single-site clonal trials were simulated with a total of 256 clones "planted" in single-tree plots with three different environmental patterns: only patches (PATCH), only gradients (GRAD), and both components (ALL). Several simulated experimental designs were analyzed (a randomized complete block design; incomplete block designs with 4, 8, 16, and 32 incomplete blocks; and a row-column design) and compared with post hoc blocking of the same designs over a randomized complete block. Additionally, two more incomplete block designs (64 and 128 blocks) were superimposed after the fact to examine extremely small blocks. To select the best fit, the performance of the log-likelihood and mean standard error of the difference (SED) were studied and compared with mean individual broad-sense heritability. Improvement in statistical efficiency (or precision) were obtained with little effort using post hoc blocking. The results from post hoc blocking were promising with negligible differences compared with predesigned local control. The post hoc best designs were row-column (for ALL and PATCH) and incomplete block with eight blocks (for GRAD). Also, mean correlation between the true and predicted values (CORR) showed a reduction in efficiency for extremely small blocks, but no reduction in the genetic variance was noted as the size of the block decreased. Both of the criteria for model selection (log-likelihood and SED) showed similar trend to mean CORR, and their use is recommended.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,009
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,183
Score d'incertitude au seuil0,987

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0090,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,141
Tête enseignante GPT0,456
Écart entre enseignants0,315 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle