MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2016545633 · doi:10.1097/fpc.0b013e3282f3606e

A novel CYP2A6 allele, CYP2A6*23, impairs enzyme function in vitro and in vivo and decreases smoking in a population of Black-African descent

2008· article· en· W2016545633 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuePharmacogenetics and Genomics · 2008
Typearticle
Langueen
DomainePharmacology, Toxicology and Pharmaceutics
ThématiquePharmacogenetics and Drug Metabolism
Établissements canadiensCanada Research ChairsUniversity of TorontoCentre for Addiction and Mental Health
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCYP2A6PharmacogeneticsAlleleIn vivoGeneticsAllele frequencyBiologyPopulationDescent (aeronautics)EnzymeIn vitroGeneMedicineGenotypeGeographyEnvironmental healthBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: CYP2A6 is the main enzyme involved in nicotine metabolism in humans. We have identified a novel allele, CYP2A6*23 (2161C>T, R203C), in individuals of Black-African descent and investigated its impact on enzyme activity and association with smoking status. METHODS: Wild-type and variant enzymes containing amino acid changes R203C (CYP2A6*23), R203S (CYP2A6*16) and V365M (CYP2A6*17) were expressed in Escherichia coli. The effect of CYP2A6*23 in vivo was examined in individuals of Black-African descent given 4 mg oral nicotine. RESULTS: CYP2A6*23 occurred at an allele frequency of 2.0% in individuals of Black-African descent (N=560 alleles, 95% confidence interval, 0.8-3.1%) and was not detected in Caucasians (N=334 alleles), Chinese (N=288 alleles) or Japanese (N=104 alleles). In vitro, CYP2A6.23 had greatly reduced activity toward nicotine C-oxidation similar to CYP2A6.17, as well as reduced coumarin 7-hydroxylation. Conversely, CYP2A6.16 did not differ in activity compared with the wild-type enzyme. The trans-3'-hydroxycotinine to cotinine ratio, a phenotypic measure of CYP2A6 activity in vivo, was lower in CYP2A6*1/*23 and CYP2A6*23/*23 individuals (mean adjusted ratio of 0.60, n=5) compared with CYP2A6*1/*1 individuals (mean adjusted ratio of 1.21, n=150) (P<0.04). CYP2A6*23 trended toward a higher allele frequency in nonsmokers (3.1%, N=9/286 alleles) compared with smokers (0.7%, N=2/274 alleles) (P=0.06). CONCLUSION: These results suggest the novel CYP2A6*23 allele impairs enzyme function in vitro and in vivo and trends toward an association with lower risk of smoking.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,419
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,066
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,279 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle