Contribution of potential EF hand motifs to the calcium‐dependent gating of a mouse brain large conductance, calcium‐sensitive K<sup>+</sup> channel
Notice bibliographique
Résumé
1. The large conductance, calcium-sensitive K(+) channel (BK(Ca) channel) is a unique member of the K(+)-selective ion channel family in that activation is dependent upon both direct calcium binding and membrane depolarization. Calcium binding acts to dynamically shift voltage-dependent gating in a negative or left-ward direction, thereby adjusting channel opening to changes in cellular membrane potential. 2. We hypothesized that the intrinsic calcium-binding site within the BK(Ca) channel alpha subunit may contain an EF hand motif, the most common, naturally occurring calcium binding structure. Following identification of six potential sites, we introduced a single amino acid substitution (D/E to N/Q or A) at the equivalent of the -z position of a bona fide EF hand that would be predicted to lower calcium binding affinity at each of the six sites. 3. Using macroscopic current recordings of wild-type and mutant BK(Ca) channels in excised inside-out membrane patches from HEK 293 cells, we observed that a single point mutation in the C-terminus (Site 6, FLD(923)QD to N), adjacent to the 'calcium bowl' described by Salkoff and colleagues, shifted calcium-sensitive gating right-ward by 50--65 mV over the range of 2--12 microM free calcium, but had little effect on voltage-dependent gating in the absence of calcium. Combining this mutation at Site 6 with a similar mutation at Site 1 (PVD(81)EK to N) in the N-terminus produced a greater shift (70--90 mV) in calcium-sensitive gating over the same range of calcium. We calculated that these combined mutations decreased the apparent calcium binding affinity approximately 11-fold (129.5 microM vs. 11.3 microm) compared to the wild-type channel. 4. We further observed that a bacterially expressed protein encompassing Site 6 of the BK(Ca) channel C-terminus and bovine brain calmodulin were both able to directly bind (45)Ca(2+) following denaturation and polyacrylamide gel electrophoresis (e.g. SDS-PAGE). 5. Our results suggest that two regions within the mammalian BK(Ca) channel alpha subunit, with sequence similarities to an EF hand motif, functionally contribute to the calcium-sensitive gating of this channel.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».