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Enregistrement W2017436068 · doi:10.1016/j.neuroimage.2015.01.032

BrainPrint: A discriminative characterization of brain morphology

2015· article· en· W2017436068 sur OpenAlexfundno aff
Christian Wachinger, Polina Golland, William S. Kremen, Bruce Fischl, Martin Reuter

Notice bibliographique

RevueNeuroImage · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMathematics
ThématiqueMorphological variations and asymmetry
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Institute of Biomedical Imaging and BioengineeringNational Institute of Mental HealthNational Center for Complementary and Integrative HealthNational Institute on AgingNational Cancer Institute, Cairo UniversityAthinoula A. Martinos Center for Biomedical Imaging, Massachusetts General HospitalNational Institutes of HealthNational Cancer InstituteServierNIH Blueprint for Neuroscience ResearchFujirebio EuropeEisaiBiogenPfizerCanadian HIV Trials Network, Canadian Institutes of Health ResearchBioClinicaSynarcAssociation France AlzheimerNational Institute of Neurological Disorders and StrokeIXICOTakeda Pharmaceutical CompanyMedpaceNational Center for Research ResourcesF. Hoffmann-La RocheMassachusetts General HospitalNovartis Pharmaceuticals CorporationU.S. Department of DefenseEli Lilly and CompanyBristol-Myers SquibbGE HealthcareAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeNational Center for Complementary and Alternative MedicineMeso Scale DiagnosticsJohnson and Johnson Pharmaceutical Research and DevelopmentHarvard NeuroDiscovery CenterAlzheimer's Drug Discovery FoundationMerckAlzheimer's AssociationFoundation for the National Institutes of HealthGenentechAlexander von Humboldt-StiftungCentre d'Imagerie BioMédicaleEllison Medical Foundation
Mots-clésDiscriminative modelArtificial intelligenceBrain morphometryComputer sciencePattern recognition (psychology)Representation (politics)Similarity (geometry)Characterization (materials science)Polygon meshMagnetic resonance imagingImage (mathematics)MedicinePhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We introduce BrainPrint, a compact and discriminative representation of brain morphology. BrainPrint captures shape information of an ensemble of cortical and subcortical structures by solving the eigenvalue problem of the 2D and 3D Laplace-Beltrami operator on triangular (boundary) and tetrahedral (volumetric) meshes. This discriminative characterization enables new ways to study the similarity between brains; the focus can either be on a specific brain structure of interest or on the overall brain similarity. We highlight four applications for BrainPrint in this article: (i) subject identification, (ii) age and sex prediction, (iii) brain asymmetry analysis, and (iv) potential genetic influences on brain morphology. The properties of BrainPrint require the derivation of new algorithms to account for the heterogeneous mix of brain structures with varying discriminative power. We conduct experiments on three datasets, including over 3000 MRI scans from the ADNI database, 436 MRI scans from the OASIS dataset, and 236 MRI scans from the VETSA twin study. All processing steps for obtaining the compact representation are fully automated, making this processing framework particularly attractive for handling large datasets.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0030,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,103
Tête enseignante GPT0,330
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations182
Publié2015
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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