Functional Screening of Cytochrome P450 Activity and Uncoupling by Capillary Electrophoresis
Notice bibliographique
Résumé
Cytochrome P450s (CYPs) are functionally diverse monooxygenases responsible for oxidation of endogenous and xenobiotic compounds. The function of nonmammalian CYPs are largely unknown and tools for characterization limited. CYPs critical for xenobiotic metabolism are prone to catalytic cycle uncoupling resulting in reactive oxygen species (ROS) generation that is highly dependent on the specific CYP isoform and substrate interaction. This study describes the rapid assessment of the activity and coupling efficiency of CYPs using capillary electrophoresis with UV detection. The coupling efficiency of five zebrafish (Danio rerio) CYP1 isoforms with a series of fluorogenic substrate probes was determined by the rate of NADP(+) formation and compared with fluorescent product turnover rates. In most cases, NADP(+) formation significantly overestimated CYP1 catalytic activity for substrate O-dealkylation suggesting uncoupling. ROS production was confirmed by elevated hydrogen peroxide generation in poorly coupled reactions. Reactions with β-estradiol confirmed that CYP1A, 1C1, and 1C2 have greater catalytic activity and coupling efficiency; CYP1B1 and 1D1 had coupling efficiencies under 4%. This work highlights the wide disparity in uncoupling induced by unproductive substrate binding among different CYP isoforms.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».