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Enregistrement W2017868038 · doi:10.4161/chan.3.6.10053

Bimodal agonism in heteromeric cyclic nucleotide-gated channels

2009· article· en· W2017868038 sur OpenAlexaff
Kerry S.C. Chan, Edgar C. Young

Notice bibliographique

RevueChannels · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueNeuroscience and Neuropharmacology Research
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCyclic nucleotide-gated ion channelTetramerBiophysicsProtein subunitChemistryPatch clampCatfishIon channelAllosteric regulationSecond messenger systemMechanism of actionStereochemistryBiochemistryCell biologyCyclic nucleotideNucleotideBiologySignal transductionReceptorEnzymeIn vitro

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Direct binding of cGMP or cAMP to tetrameric cyclic nucleotide-gated (CNG) channels will normally promote the open (conductive) conformation. However, the catfish CNGA2 subtype exhibits bimodal agonism, whereby open probability (P(o)) increases with initial cGMP binding events ("pro" action) but decreases with subsequent cGMP binding events ("con" action) that occur at concentrations above 3 mM. We constructed, and heterologously expressed, chimeric CNG channel subunits with sequence substitutions in the binding domain (BD), and tested their activation using patch-clamp of cell-free membranes. A normal subunit with the rat CNGA4 BD (with only pro action) could be converted into a bimodal subunit (both pro and con action) by replacing the N-terminal portion of the BD with catfish CNGA2 sequence. We then fused two bimodal and two normal subunits in tandem tetramers, to form heteromeric CNG channels with bimodal pseudosubunits either adjacent (cis) or diagonally opposite (trans). The cis tetramer showed con action, with a mean ratio of steady-state conductances g((30 mM cGMP))/g((3 mM cGMP)) = 0.87, demonstrating bimodal agonism in a heteromeric CNG channel for the first time. In contrast, trans tetramers showed normal cGMP agonism up to 30 mM cGMP with mean g((30 mM cGMP))/g((3mM cGMP))= 1.02, although a minority of oocytes (4 of 15) expressed anomalous channel populations with con action. Rearranging subunits in a heteromer thus influences a channel's P(o) at high cGMP concentration. The sensitivity of con action to neighbouring subunits implies a cooperative mechanism.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,066
Tête enseignante GPT0,343
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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