Phylogeny and taxonomic revision of Thelonectria discophora (Ascomycota, Hypocreales, Nectriaceae) species complex
Notice bibliographique
Résumé
Specimens regarded as Thelonectria discophora ( Thelonectria , Nectriaceae , Hypocreales ) constitute a conspicuous group of saprobic fungi on decaying plant material, characterized by red perithecia each with a broad mammiform (nipple-like) apex. The asexual state is characterized by a cylindrocarpon-like morphology, with 3–5 septate macroconidia, unicellular microconidia and chlamydospores that are rarely produced in culture. In the past, T. discophora was regarded as one species with a wide geographic distribution. However, a recent study rejected the monophyly and cosmopolitan distribution of this species , and showed the existence of at least 16 cryptic species distributed in three main groups. By combining the results of phylogenetic analyses of six nuclear loci and morphological studies, we revised the taxonomy of the T. discophora species complex, resulting in the description of 12 new species and four new combinations based on historic names. Even though molecular phylogenetic analyses strongly support the segregation of these species, and are in agreement with previous studies, individual diagnostic morphological characters for each species could not be identified. However, discrete morphological traits corresponding to each of the three main groups of species were discovered. Lineages could be differentiated based on the average values of morphological traits as well as the presence/absence of characteristic asexual propagules and colony growth at 30C. Descriptions, illustrations are provided for the recognized species.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,003 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».