Distinctive gene profiles occur at key points during natural metamorphosis in the <i>Xenopus laevis</i> tadpole tail
Notice bibliographique
Résumé
Thyroid hormones (THs) are essential for tadpole metamorphosis into a juvenile frog; however, a complex interplay between additional hormones and signaling events also contributes to this dramatic developmental phase. A major mechanism of TH action is the nuclear receptor-mediated regulation of gene transcription of responsive genes. By using the precocious metamorphic model, several genes have been identified as TH responsive in the regressing tail. Many of these genes also exhibit altered expression during natural metamorphosis. Although identification of these genes provides insight into the mechanism whereby TH acts, complex interplay between TH and other hormones and the developmental stage-dependency of tissue responses contribute to the timing and coordination of metamorphic events. We investigated the temporal gene expression profile in Xenopus laevis tadpole tails from premetamorphosis through metamorphic climax by using a combination of a novel frog cDNA array containing 420 genes and quantitative real-time PCR. Seventy-nine genes were identified whose steady-state mRNA expression levels were altered in the tadpole tail during natural metamorphosis, of which 34 have previously been identified to be TH responsive in frogs or mammals. Of these genes, 75 clustered into 13 groups that displayed distinct developmental expression profiles. The levels of 28 transcripts were altered during premetamorphosis, 31 during prometamorphosis, and 43 with the onset of tail regression. This work establishes an important baseline for determining the mechanisms whereby tissues undergo differing metamorphic fates.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».