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Enregistrement W2018837575 · doi:10.1002/prot.22661

UV and X‐ray structural studies of a 101‐residue long Tat protein from a HIV‐1 primary isolate and of its mutated, detoxified, vaccine candidate

2009· article· en· W2018837575 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueProteins Structure Function and Bioinformatics · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensHôpital Saint-LucCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSmall-angle X-ray scatteringCircular dichroismTransactivationMutantChemistryHuman immunodeficiency virus (HIV)Residue (chemistry)Protein secondary structureFluorescenceIn vitroSize-exclusion chromatographyCrystallographyBiophysicsBiochemistryBiologyScatteringVirologyEnzymeGenePhysics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The 101-residue long Tat protein of primary isolate 133 of the human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1), wt-Tat(133) displays a high transactivation activity in vitro, whereas the mutant thereof, STLA-Tat(133), a vaccine candidate for HIV-1, has none. These two proteins were chemically synthesized and their biological activity was validated. Their structural properties were characterized using circular dichroism (CD), fluorescence emission, gel filtration, dynamic light scattering, and small angle X-ray scattering (SAXS) techniques. SAXS studies revealed that both proteins were extended and belong to the family of intrinsically unstructured proteins. CD measurements showed that wt-Tat(133) or STLA-Tat(133) underwent limited structural rearrangements when complexed with specific fragments of antibodies. Crystallization trials have been performed on the two forms, assuming that the Tat(133) proteins might have a better propensity to fold in supersaturated conditions, and small crystals have been obtained. These results suggest that biologically active Tat protein is natively unfolded and requires only a limited gain of structure for its function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,496
Score d'incertitude au seuil0,685

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle