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Enregistrement W2018991353 · doi:10.1126/science.1194167

Plasticity of Animal Genome Architecture Unmasked by Rapid Evolution of a Pelagic Tunicate

2010· article· en· W2018991353 sur OpenAlexaff
France Denœud, Simon Henriet, Sutada Mungpakdee, Jean‐Marc Aury, Corinne Da Silva, Henner Brinkmann, Yana Mikhaleva, Lisbeth C. Olsen, Claire Jubin, Cristian Cañestro, Jean‐Marie Bouquet, Gemma Danks, Julie Poulain, Coen Campsteijn, Marcin Adamski, Ismael Cross, Fekadu Yadetie, Matthieu Muffato, Alexandra Louis, Stephen Butcher, Georgia Tsagkogeorga, Anke Konrad, Sarabdeep Singh, Marit Flo Jensen, Evelyne Huynh Cong, Helen Eikeseth-Otteraa, Benjamin Noël, Véronique Anthouard, Betina M. Porcel, Rym Kachouri‐Lafond, Atsuo Nishino, Matteo Ugolini, Pascal Chourrout, Hiroki Nishida, Rein Aasland, Snehalata Huzurbazar, Éric Westhof, Frédéric Delsuc, Hans Lehrach, Richard Reinhardt, Jean Weissenbach, Scott William Roy, François Artiguenave, John H. Postlethwait, J. Robert Manak, Eric M. Thompson, Olivier Jaillon, Louis Du Pasquier, Pierre Boudinot, David A. Liberles, Jean‐Nicolas Volff, Hervé Philippe, Boris Lenhard, Hugues Roest Crollius, Patrick Wincker, Daniel Chourrout

Notice bibliographique

RevueScience · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMarine Ecology and Invasive Species
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesNational Institutes of Health
Mots-clésBiologyChordateGenomeEvolutionary biologyTunicateLineage (genetic)Pelagic zonePhylogeneticsGeneGeneticsEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ocean Dweller Sequenced The Tunicates, which include the solitary free-swimming larvaceans that are a major pelagic component of our oceans, are a basal lineage of the chordates. In order to investigate the major evolutionary transition represented by these organisms, Denoeud et al. (p. 1381 , published online 18 November) sequenced the genome of Oikopleura dioica , a chordate placed by phylogeny between vertebrates and amphioxus. Surprisingly, the genome showed little conservation in genome architecture when compared to the genomes of other animals. Furthermore, this highly compacted genome contained intron gains and losses, as well as species-specific gene duplications and losses that may be associated with development. Thus, contrary to popular belief, global similarities of genome architecture from sponges to humans are not essential for the preservation of ancestral morphologies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesÉtudes des sciences et des technologies, Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,860
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,004
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,199
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations304
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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