Neisseria gonorrhoeae Multiantigen Sequence Typing Is Beneficial in Further Characterizing Gonococcal Populations in Alberta, Canada
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Antimicrobial resistance testing and behavioral data combined with Neisseria gonorrhoeae multiantigen sequence typing (NG-MAST) can help to define gonococcal populations and identify, characterize, and compare clusters of infection. METHODS: Antimicrobial resistance testing, using E test, was reviewed for gonococcal isolates in Alberta, Canada, from 2007 to 2011. Antimicrobial resistance testing was conducted on isolates demonstrating antimicrobial resistance and those with cefixime minimum inhibitory concentrations (MICs) of 0.06 μg/mL or greater. Demographic and behavioral information was obtained from provincial surveillance data. NG-MAST typing was conducted on a proportion of isolates. RESULTS: Gonococcal isolates were available for 2250 (26.4%) of 8535 cases of gonorrhea in Alberta from 2007 to 2011. The proportion of cases with decreased susceptibility to cefixime (≥0.06 μg/mL) increased from 0.7% to 2.4% between 2007 and 2009 to a high of 10.1% in 2010 and 8.9% in 2011. Six isolates with cefixime MIC of 0.25 μg/mL were noted: 5 were from men who have sex with men (MSM) and 1 was a pharyngeal isolate from a heterosexual female. Twenty-four (1.1%) isolates were azithromycin resistant (MIC ≥2.0 μg/mL); there were no significant differences between cases resistant or susceptible to azithromycin. NG-MAST of gonococcal isolates in Alberta suggests the entry of multiple strains into the province. Three clusters were identified: Cluster A predominantly in MSM, including sequence type 1407, a ST previously associated with decreased susceptibility to expanded spectrum cephalosporins; Cluster B, a predominantly heterosexual cluster with most cases in Edmonton; and Cluster C among MSM. CONCLUSIONS: Our data highlight the use of NG-MAST in further defining gonococcal populations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».