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Enregistrement W2019336252 · doi:10.1063/1.3124187

Linking microscopic guest properties to macroscopic observables in clathrate hydrates: Guest-host hydrogen bonding

2009· article· en· W2019336252 sur OpenAlexaff
Saman Alavi, Robin Susilo, John A. Ripmeester

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Chemical Physics · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMethane Hydrates and Related Phenomena
Établissements canadiensSteacie Institute for Molecular Sciences
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésClathrate hydrateChemistryHydrogen bondCyclopentaneMolecular dynamicsChemical physicsTetrahydrofuranCrystallographyMoleculePhysical chemistryComputational chemistryHydrateStereochemistrySolventOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Molecular dynamics simulations are used to compare microscopic structures and guest dynamics to macroscopic properties in structure II clathrate hydrates with cyclopentane, tetrahydrofuran (THF), 1,3-dioxolane, tetrahydropyran (THP), and p-dioxane as guests. Significant differences are observed between structural parameters and rotational dynamics for the different guests. The simulations show the formation of guest-host hydrogen bonds between the ether oxygen atoms of THF and THP and the cage water hydrogen atoms of the clathrate but the absence of similar hydrogen bonds in the clathrate hydrates of the other guests on the time scale of the calculations. This guest-host hydrogen bonding leads to the formation of Bjerrum L-defects in the clathrate water lattice where two adjacent water molecules have no covalently bonded hydrogen atom between them. Unlike Bjerrum defects of ice lattices, these guest-induced L-defects are not accompanied by the formation of a D-defect at an adjacent site in the water lattice. At the simulation temperature of 200 K, the guest-water hydrogen bonds in the THF clathrate are short lived (lifetime less than 1 ps) but in the THP they are longer lived (a minimum of 100 ps). A van't Hoff plot for the probability of defect formation in THF as a function of temperature gives an activation barrier of approximately 8.3 kJ/mol for guest-host defect formation in the THF clathrate. The consequences of the defect formation on the thermal expansivity, isothermal compressibility, dipole-dipole correlation function, and mechanical stability of the clathrate are discussed.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,525

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations159
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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