Spatial Distribution of Histone Isoforms on the Bovine Active and Inactive X Chromosomes
Notice bibliographique
Résumé
The inactive X chromosome (Xi) in female mammals serves as an important model for studying the role of histone isoforms in directing specific nuclear processes leading to inherited differences in transcription. In the present study, we investigated the distribution of some histone isoforms known to be involved in the process of human X inactivation on their bovine counterparts. To ascertain the identity of active and inactive X chromosome, their distribution was investigated on the X chromosomes in a cell line derived from a bovine female carrying an X;autosome translocation rcp(Xp+;23q-) which allowed the recognition of the maternal (translocated) and paternal (normal) X chromosome. The distribution patterns of histone H3 trimethylated at lysine 9 (H3K9me3) and trimethylated at lysine 27 (H3K27me3), and histone macroH2A1 and macroH2A2 (isoforms specific to heterochromatin) were determined by immunocytochemistry and compared to the temporal pattern of replication using BrdU pulse labeling prior to staining. Immunostaining revealed that H3K9me3, H3K27me3, and macroH2A1 are preferentially concentrated on the Xi, whereas the histone variant macroH2A2 is not a marker for this chromosome. H3K9me3, H3K27me3, and macroH2A1 were consistently located in bands along the Xi, while H3K9me3, macroH2A1 and macroH2A2 localized in the pericentromeric regions of the autosomes. H3K27me3 identified two intense bands on the Xi at Xp22 and Xq31, representing the early replication regions of the chromosome. H3K27me3 and macroH2A1 overlapped in the Xq31 region. It was concluded that different heterochromatin regions on the bovine inactive X chromosome can be identified by their histone isoform composition.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».