A Polymerase Chain Reaction–Based Genotyping Assay for Detecting a Novel Sandhoff Disease–Causing Mutation
Notice bibliographique
Résumé
Sandhoff disease is a rare genetic disorder, however, some northern Saskatchewan communities have a high incidence of the disease (for which the causative mutation has not been described). We discovered a novel mutation causing Sandhoff disease in this community and validated a molecular assay to detect the mutant allele. DNA sequencing was used to search for mutations in the HEXB gene from the most recently affected patient. A polymerase chain reaction (PCR)-based genotyping assay was subsequently designed and validated to detect a novel single-nucleotide deletion using DNA isolated from newborn screening cards. The c.115delG mutation was found in exon 1 of the HEXB gene from 4 patients with clinical presentation of Sandhoff disease. Herein we describe a novel HEXB mutation that is shared among 4 patients with Sandhoff disease, as well as a validated PCR-based genotyping assay that can reliably detect the mutant allele. Because the 4 patients from this community share a common c.115delG mutation in the coding region of the HEXB gene, it may be possible to offer an effective preventive screening program for Sandhoff disease using this assay.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».