The Kinetics of Helix Unfolding of an Azobenzene Cross-Linked Peptide Probed by Nanosecond Time-Resolved Optical Rotatory Dispersion
Notice bibliographique
Résumé
The unfolding dynamics of a 16 amino acid peptide (Ac-EACAREAAAREAACRQ-NH(2), FK-11-X) was followed using nanosecond time-resolved optical rotatory dispersion (ORD). The peptide was coupled to an azobenzene linker that undergoes subnanosecond photoisomerization and reisomerizes on a time scale of minutes. When the linker is in the trans form, the peptide favors a more helical structure (66% helix/34% disordered) and when in the cis configuration the helical content is reduced. Unfolding of FK-11-X was rapidly triggered by a 7-ns laser pulse at 355 nm, forming cis azobenzene-linked peptides that maintained the secondary structure (helical or disordered) of their trans azobenzene counterparts. The incompatibility of the instantaneous cis photoproduct with helical secondary structure drives the subsequent peptide unfolding to a new conformational equilibrium between cis helix and cis disordered structures. The kinetic results show a approximately 40% decrease in the time-dependent ORD signal at 230 nm that is best fit to a single-exponential decay with a time constant of 55 +/- 6 ns. Folding and unfolding rates for cis FK-11-X are estimated to be approximately 3.0 x 10(6) s(-)(1) (1/330 ns) and approximately 1.5 x 10(7) s(-)(1) (1/66 ns), respectively.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,002 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».