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Enregistrement W2019887943 · doi:10.1186/1471-2407-9-165

Inter-observer reproducibility of HER2 immunohistochemical assessment and concordance with fluorescent in situhybridization (FISH): pathologist assessment compared to quantitative image analysis

2009· article· en· W2019887943 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueBMC Cancer · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHER2/EGFR in Cancer Research
Établissements canadiensBC Cancer AgencyCentre for Advancing Health OutcomesUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchSanofi
Mots-clésKappaConcordanceMedicineImmunohistochemistryFish <Actinopterygii>PathologyBreast cancerCohen's kappaInternal medicineTissue microarrayReproducibilitySurgical oncologyCancerBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: In breast cancer patients, HER2 overexpression is routinely assessed by immunohistochemistry (IHC) and equivocal cases are subject to fluorescent in situ hybridization (FISH). Our study compares HER2 scoring by histopathologists with automated quantitation of staining, and determines the concordance of IHC scores with FISH results. METHODS: A tissue microarray was constructed from 1,212 invasive breast carcinoma cases with linked treatment and outcome information. IHC slides were semi-quantitatively scored by two independent pathologists on a range of 0 to 3+, and also analyzed with an Ariol automated system by two operators. 616 cases were scorable by both IHC and FISH. RESULTS: Using data from unequivocal positive (3+) or negative (0, 1+) results, both visual and automated scores were highly consistent: there was excellent concordance between two pathologists (kappa = 1.000, 95% CI: 1-1), between two machines (kappa = 1.000, 95% CI: 1-1), and between both visual and both machine scores (kappa = 0.898, 95% CI: 0.775-0.979). Two pathologists successfully distinguished negative, positive and equivocal cases (kappa = 0.929, 95% CI: 0.909-0.946), with excellent agreement with machine 1 scores (kappa = 0.835, 95% CI: 0.806-0.862; kappa = 0.837, 95% CI: 0.81-0.862), and good agreement with machine 2 scores (kappa = 0.698, 95% CI: 0.6723-0.723; kappa = 0.709, 95% CI: 0.684-0.732), whereas the two machines showed good agreement (kappa = 0.806, 95% CI: 0.785-0.826). When comparing categorized IHC scores and FISH results, the agreement was excellent for visual 1 (kappa = 0.814, 95% CI: 0.768-0.856), good for visual 2 (kappa = 0.763, 95% CI: 0.712-0.81) and machine 1 (kappa = 0.665, 95% CI: 0.609-0.718), and moderate for machine 2 (kappa = 0.535, 95% CI: 0.485-0.584). CONCLUSION: A fully automated image analysis system run by an experienced operator can provide results consistent with visual HER2 scoring. Further development of such systems will likely improve the accuracy of detection and categorization of membranous staining, making this technique suitable for use in quality assurance programs and eventually in clinical practice.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,057
Score d'incertitude au seuil0,688

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,069
Tête enseignante GPT0,457
Écart entre enseignants0,388 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle