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Enregistrement W2020557524 · doi:10.1093/eurheartj/ehp250

Identification of a novel human cellular HDL biosynthesis defect

2009· article· en· W2020557524 sur OpenAlexaffabout
Shahidur Rashid, Michel Marcil, Isabelle L. Ruel, Jacques Genest

Notice bibliographique

RevueEuropean Heart Journal · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCholesterol and Lipid Metabolism
Établissements canadiensMcGill University Health CentreHamilton Health Sciences
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineIdentification (biology)Computational biologyBiosynthesisGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

AIMS: Severe high-density lipoprotein cholesterol (HDL-C) deficiency is attributed to mutations in several genes and may contribute to the genetic basis of coronary artery disease. To identify the cellular basis of a novel HDL-deficiency phenotype, we screened 54 subjects of French Canadian ancestry with severe HDL deficiency. METHODS AND RESULTS: We excluded individuals with mutations in genes currently associated with low HDL (ABCA1, LCAT, APOA-I, and SMPD1). We identified two patients in which cellular phospholipid efflux in the HDL biosynthesis process is impaired, whereas cholesterol efflux is normal. Two-dimensional gel electrophoresis analysis further showed that the two patients with impaired phospholipid efflux were defective primarily in the larger alpha-HDL subpopulations. In fibroblasts from affected subjects, oxysterol stimulation resulted in increased ABCA1 protein expression and normalized their defective phospholipid efflux defect. CONCLUSION: Our results indicate for the first time in humans that phospholipid and cholesterol efflux are two separate and distinct processes in cellular HDL biosynthesis. They further show for the first time that normal cellular phospholipid efflux is necessary for the formation of larger alpha-HDL particles. The defect in phospholipid efflux is due to defective ABCA1 protein regulation and can be corrected by treatment with physiological oxysterols, a current therapeutic target of interest, that may, with further studies, be used to raise HDL levels in patients with severe HDL deficiencies.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,049

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,259 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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