Development of sequence-characterized amplified region (SCAR) markers for resistance gene<i>Pc94</i>to crown rust in oat
Notice bibliographique
Résumé
Crown rust, caused by Puccinia coronata f. sp. avenae, is an important disease of oat (Avena sativa). Pyramiding effective resistance from diverse sources is one strategy to provide more durable control of crown rust. The objective of this study was to develop a DNA marker for the resistance gene Pc94 to crown rust derived from the diploid oat Avena strigosa. Amplified fragment length polymorphism generated two DNA fragments that were associated with the resistance gene Pc94 in a F2 population derived from a cross between the rust-susceptible oat 'Calibre' and a near-isogenic hexaploid oat line, S42, possessing Pc94. One of the fragments was successfully converted into two sequence-characterized amplified region (SCAR) markers linked to the Pc94 gene in the Calibre/S42 F2 population. Specificity of the SCAR markers to the Pc94 gene was confirmed in three other populations. The estimated distance between the SCAR markers and Pc94 ranged from 0.9 to 3.4 centi-Morgan. These SCAR markers developed for the Pc94 gene will be valuable tools for pyramiding this gene with other resistance genes to crown rust in marker-assisted breeding programs when crown-rust races with the appropriate virulence combinations are not available to detect the genes being introgressed.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».