Site-Directed Spin-Labeling of the Catalytic Sites Yields Insight into Structural Changes within the F<sub>o</sub>F<sub>1</sub>-ATP Synthase of <i>Escherichia coli</i>
Notice bibliographique
Résumé
Electron spin resonance (ESR) spectroscopy using site-specific cysteine spin-labeling of the catalytic nucleotide binding sites of F(1)-ATPase was employed to investigate conformational changes within the nucleotide binding sites of the enzyme. Mutant Escherichia coli F(1) that had been modified at position beta-Y331C with a spin label showed almost normal catalytic activity and enabled us to study the effects of binding of different nucleotides and of the F(o) subunit b on the conformation of the catalytic binding sites. The ESR spectra of the spin-labeled, nucleotide-depleted F(1) indicate asymmetry within the sites as is expected from the structural models of the enzyme. Nucleotide binding to the enzyme clearly affects the conformation of the sites; the most pronounced feature upon nucleotide binding is the formation of catalytic site(s) in a very open conformation. Using the same beta-331 spin-labeled F(1) and a truncated form of F(o) subunit b, b(24)(-)(156), we found that binding of b(24)(-)(156) to spin-labeled F(1) significantly changes the conformation of the catalytic sites. In this paper we present data that for the first time directly show that a conformational binding change takes place upon binding of nucleotides to the nucleotide binding sites and that also show that binding of b(24)(-)(156) strongly affects the conformation of the catalytic sites, most likely by increasing the population of binding sites that are in the open conformation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».