A Myocyte Enhancer Factor 2 (MEF2) Site Located in a Hypersensitive Region of the FGF16 Gene Locus Is Required for Preferential Promoter Activity in Neonatal Cardiac Myocytes
Notice bibliographique
Résumé
Fibroblast growth factor 16 (FGF16) is preferentially expressed in the heart after birth, suggesting its regulation is associated with tissue-specific chromatin remodeling and DNA-protein interactions. Here we have mapped the transcription initiation site of murine FGF16 to approximately 1.1 kilobases (kb) upstream of the translation start codon (ATG). Hybrid reporter genes directed by about 4.7 kb of upstream FGF16 DNA were expressed specifically in transfected neonatal rat cardiac myocytes, as well as in the heart of transgenic mice. A DNaseI hypersensitive site was mapped to a region about 1.2 kb upstream of the transcription initiation site in heart but not kidney tissue, and a nuclease protection assay gave evidence of a cardiac-specific protein-DNA interaction in this region. Deletion analysis indicated that a hybrid gene with 1205 bp but not 1054 bp of upstream DNA directed FGF16 promoter activity in transfected neonatal rat cardiac myocytes. We identified a putative myocyte enhancer factor 2 (MEF2)-binding site at nucleotides -1159/-1148, confirmed by electrophoretic mobility shift assay and MEF2 antibody binding. Mutation of the MEF2 site resulted in a blunting of FGF16 promoter activity in transfected neonatal rat cardiac myocytes. These data suggest that chromatin remodeling and MEF2 binding in the FGF16 promoter contribute to expression in the postnatal heart.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».