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Enregistrement W2021469685 · doi:10.1042/0264-6021:3600127

Replication of HIV-1 viruses in the presence of the Portland α1-antitrypsin variant (α1-PDX) inhibitor

2001· article· fr· W2021469685 sur OpenAlexaff
Bouchaib Bahbouhi, Nabil G. Seidah, Elmostafa Bahraoui

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2001
Typearticle
Languefr
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensMontreal Clinical Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGp41InfectivityBiologyJurkat cellsEctodomainTransfectionMolecular biologyViral replicationVirologyCell fusionFurinCell cultureVirusBiochemistryT cellEpitopeAntibodyGeneticsEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Portland alpha1-antitrypsin variant (alpha1-PDX) inhibits gp160 cleavage into gp120 and gp41 by different prohormone convertases (PCs) including furin, PC5 and PC7. Jurkat cells stably transfected with this inhibitor (J-PDX cells) and, as controls, Jurkat cells transfected with the empty vector (J-pcDNA3) were tested for their susceptibility to HIV-1 infection. We found that HIV-1 replication was significantly impaired in J-PDX cells. However, the analysis of the infectivity of HIV-1 viruses produced in J-PDX cells on different days during the infection indicated that they recovered infectivity starting from 13 days post-infection. The sequencing of viruses collected earlier and later from J-PDX cells revealed no mutations in envelope-glycoprotein precursor (Env) maturation sites or in the N-terminal sequence of gp41 fusion peptide, which plays a key role in membrane fusion. Although conserved mutations were detected at the C-terminus of the gp41 fusion peptide and ectodomain, the replication of mutant HIV-1 viruses produced on day 20 in J-PDX cells was inhibited at a similar level to wild-type viruses after a second passage in J-PDX cells. We then investigated the expression of the alpha1-PDX protein, and found that HIV-1 replication activated its proteolysis since the 54 kDa cleaved form became predominant later on in the infection. In contrast, the expression of PC7, a protein that is transported through the secretory pathway, was unaltered in HIV-1 infected cells. We conclude that recovered HIV-1 infectivity in J-PDX cells was due to a loss of alpha1-PDX activity via its extensive processing by intracellular proteases that cleave it through the substrate pathway.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,030
Score d'incertitude au seuil0,538

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,025
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations9
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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