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Enregistrement W2021523247 · doi:10.3851/imp1565

Opposite effect of two cytomegalovirus DNA polymerase mutations on replicative capacity and polymerase activity

2010· article· en· W2021523247 sur OpenAlexafffund
Mélanie Martin, Arezki Azzi, Sheng‐Xiang Lin, Guy Boivin

Notice bibliographique

RevueAntiviral Therapy · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytomegalovirus and herpesvirus research
Établissements canadiensUniversité LavalCentre hospitalier universitaire de Québec
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchGilead Sciences
Mots-clésFoscarnetRecombinant DNABiologyMolecular biologyDNA polymeraseVirologyPolymeraseGanciclovirAphidicolinHuman cytomegalovirusMutantVirusEnzymeWild typeGeneBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Human cytomegalovirus (HCMV) infections cause significant morbidity in immunocompromised hosts. The aim of this study was to characterize the role of two HCMV DNA polymerase mutations (K805Q and T821I) found in a ganciclovir- and foscarnet-resistant clinical isolate from an AIDS patient. METHODS: The effects of single and dual DNA polymerase mutations on virus susceptibility and replicative capacity, as well as on enzymatic activity, were studied using recombinant viruses generated from overlapping cosmids and DNA polymerase enzymes expressed in rabbit reticulocyte lysates. RESULTS: Recombinant viruses containing mutations K805Q, T821I and K805Q+T821I had 0.8-fold, 5.3-fold and 4.8-fold increases in ganciclovir 50% inhibitory concentration (IC(50)) values and 0.3-fold, 23.3-fold and 15.6-fold increases in foscarnet IC(50) values, respectively, compared with those of the wild-type virus. The recombinant virus T821I had impaired replication in fibroblastic cells on day 2 post-infection with a decrease in viral titres of 3.5-fold, 4.3-fold and 2.6-fold compared to the recombinant wild-type, K805Q and K805Q+T821I viruses, respectively. Enzymatic studies of wild-type and mutant DNA polymerase enzymes in presence of foscarnet resulted in IC(50) values that were similar to those of the recombinant viruses. Steady-state kinetic constants K(m) and V(max) derived from Michaelis-Menten equations showed that the activity of the mutant T821I enzyme was diminished compared with those of wild-type, K805Q and K805Q+T821I mutant enzymes. Thermodynamic stability of the two single mutant enzymes was opposed as shown by computer-assisted three-dimensional modelling studies. CONCLUSIONS: The HCMV DNA polymerase mutation K805Q improved the fitness of the T821I mutation associated with high levels of resistance to foscarnet.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,127
Score d'incertitude au seuil0,943

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,318 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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