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Enregistrement W2021886842 · doi:10.1021/jp049406e

Reactions of One-Electron-Oxidized Methionine with Oxygen:  An ab Initio Study

2004· article· en· W2021886842 sur OpenAlexaff
Mei Lan Huang, Arvi Rauk

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry A · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueFree Radicals and Antioxidants
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryRadicalPhotochemistryIntramolecular forceRadical ionOxygenMethanethiolSulfideSulfurMedicinal chemistryOrganic chemistryIon

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A one-electron oxidation of a methionine residue is thought to be a key step in the neurotoxicity of the beta amyloid peptide of Alzheimer's disease. The chemistry of the radical cation of N -formylmethioninamide ( 11 • + ) and two model systems, dimethyl sulfide ( 1 • + ) and ethyl methyl sulfide ( 6 • + ), in the presence of oxygen have been studied by B3LYP/6-31G(d) and CBS-RAD calculations. The stable form of 11 • + has a three-electron bond between the sulfur radical cation and the carbonyl oxygen atom of the i − 1 residue. The radical cation may lose a proton from the methyl or methylene groups flanking the oxidized sulfur. Both 11 • + and the resultant C-centered radicals may add oxygen to form peroxy radicals. The calculations indicate that unlike C-centered radicals the sulfur radical cation does not form a covalent bond to oxygen but rather forms a loose ion-induced dipole complex with an S−O separation of about 2.7 Å, and is bound by about 13 kJ mol -1 (on the basis of 1 • + + O 2 ). Direct intramolecular abstraction of an H atom from the α C site is unlikely. It is endothermic by more than 20 kJ mol -1 and involves a high barrier (Δ G = 79 kJ mol -1 ). The α-to-S C-centered radicals will add oxygen to form peroxy radicals. The OH BDEs of the parent hydroperoxides are in the range of 352−355 kJ mol -1, similar to SH BDEs (360 kJ mol -1 ) and α C−H BDEs (345−350 kJ mol -1 ). Thus, the peroxy radicals are oxidizing species comparable in strength to thiyl radicals and peptide backbone α C-centered radicals. Each peroxy radical can abstract a hydrogen atom from the backbone α C site of the Met residue to yield the corresponding α C-centered radical/hydroperoxide in a weakly exothermic process with modest barriers in the range of 64−92 kJ mol -1 .

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,426

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2004
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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