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Enregistrement W2021923583 · doi:10.1074/jbc.m009170200

Two Classes of Androgen Receptor Elements Mediate Cooperativity through Allosteric Interactions

2001· article· en· W2021923583 sur OpenAlexaff
Kimberly J. Reid, Stephen C. Hendy, Pernille Dissing Sørensen, Colleen C. Nelson

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEstrogen and related hormone effects
Établissements canadiensVancouver General Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAllosteric regulationCooperativityAndrogen receptorChemistryCooperative bindingReceptorBiophysicsCell biologyBiologyBiochemistryGeneticsBinding siteProstate cancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genes uniquely regulated by the androgen receptor (AR) typically contain multiple androgen response elements (AREs) that in isolation are of low DNA binding affinity and transcriptional activity. However, specific combinations of AREs in their native promoter context result in highly cooperative DNA binding by AR and high levels of transcriptional activation. We demonstrate that the natural androgen-regulated promoters of prostate specific antigen and probasin contain two classes of AREs dictated by their primary nucleotide sequence that function to mediate cooperativity. Class I AR-binding sites display conventional guanine contacts. Class II AR-binding sites have distinctive atypical sequence features and, upon binding to AR, the DNA structure is dramatically altered through allosteric interactions with the receptor. Class II sites stabilize AR binding to adjacent class I sites and result in synergistic transcriptional activity and increased hormone sensitivity. We have determined that the specific nucleotide variation within the AR binding sites dictate differential functions to the receptor. We have identified the role of individual nucleotides within class II sites and predicted consensus sequences for class I and II sites. Our data suggest that this may be a universal mechanism by which AR achieved unique regulation of target genes through complex allosteric interactions dictated by primary binding sequences.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,027
Score d'incertitude au seuil0,400

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,302
Écart entre enseignants0,280 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations71
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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