Structure-Switching Signaling Aptamers
Pourquoi ce travail est-il dans la base ?
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Prédiction distillée sur la base complète
Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
- Catégories candidates
- aucune
- Catégories consensuelles
- aucune
- Domaine
- Signal candidat: aucuneSignal consensuel: aucune
- Devis d'étude
- Signal candidat: Expérimental (laboratoire)Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
- Genre
- Signal candidat: EmpiriqueSignal consensuel: Empirique
- Score de désaccord entre enseignants
- 0,029
- Score d'incertitude au seuil
- 0,283
- Statut de validation
machine_predicted_unvalidated·codex-gemma-dda1882f352a
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
- Écart entre enseignants
- 0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
- Statut de validation
score_only:v0-immature-baseline· tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle
Résumé
Aptamers are single-stranded nucleic acids with defined tertiary structures for selective binding to target molecules. Aptamers are also able to bind a complementary DNA sequence to form a duplex structure. In this report, we describe a strategy for designing aptamer-based fluorescent reporters that function by switching structures from DNA/DNA duplex to DNA/target complex. The duplex is formed between a fluorophore-labeled DNA aptamer and a small oligonucleotide modified with a quenching moiety (denoted QDNA). When the target is absent, the aptamer binds to QDNA, bringing the fluorophore and the quencher into close proximity for maximum fluorescence quenching. When the target is introduced, the aptamer prefers to form the aptamer-target complex. The switch of the binding partners for the aptamer occurs in conjunction with the generation of a strong fluorescence signal owing to the dissociation of QDNA. Herein, we report on the preparation of several structure-switching reporters from two existing DNA aptamers. Our design strategy is easy to generalize for any aptamer without prior knowledge of its secondary or tertiary structure, and should be suited for the development of aptamer-based reporters for real-time sensing applications.
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La notice
- Revue
- Journal of the American Chemical Society
- Thématique
- Advanced biosensing and bioanalysis techniques
- Domaine
- Biochemistry, Genetics and Molecular Biology
- Établissements canadiens
- McMaster University
- Organismes subventionnaires
- non disponible
- Mots-clés
- AptamerChemistryOligonucleotideDNADuplex (building)Nucleic acidFluorophoreBiophysicsA-DNAFluorescenceQuenching (fluorescence)Combinatorial chemistryBiochemistryMolecular biologyBiology
- Résumé présent dans OpenAlex
- oui