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Enregistrement W2022285466 · doi:10.1021/bi000280v

Synthesis and Biophysical Properties of Arabinonucleic Acids (ANA):  Circular Dichroic Spectra, Melting Temperatures, and Ribonuclease H Susceptibility of ANA·RNA Hybrid Duplexes

2000· article· en· W2022285466 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA and Nucleic Acid Chemistry
Établissements canadiensMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésRNARNase PRNase HDNARibonucleaseDuplex (building)Nucleic acidStereochemistryChemistryOligonucleotideNucleic acid structureBase pairBiochemistryMolecular biologyBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Arabinonucleic acid (ANA), the 2'-epimer of RNA, was synthesized from arabinonucleoside building blocks by conventional solid-phase phosphoramidite synthesis. In addition, the biochemical and physicochemical properties of ANA strands of mixed base composition were evaluated for the first time. ANA exhibit certain characteristics desirable for use as antisense agents. They form duplexes with complementary RNA, direct RNase H degradation of target RNA molecules, and display resistance to 3'-exonucleases. Since RNA does not elicit RNase H activity, our findings establish that the stereochemistry at C2' (ANA versus RNA) is a key determinant in the activation of the enzyme RNase H. Inversion of stereochemistry at C2' is most likely accompanied by a conformational change in the furanose sugar pucker from C3'-endo (RNA) to C2'-endo ("DNA-like") pucker (ANA) [Noronha and Damha (1998) Nucleic Acids Res. 26, 2665-2671; Venkateswarlu and Ferguson (1999) J. Am. Chem. Soc. 121, 5609-5610]. This produces ANA/RNA hybrids whose CD spectra (i.e., helical conformation) are more similar to the native DNA/RNA substrates than to those of the pure RNA/RNA duplex. These features, combined with the fact that ara-2'OH groups project into the major groove of the helix (where they should not interfere with RNase H binding), help to explain the RNase H activity of ANA/RNA hybrids.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,194
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle