MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2022699022 · doi:10.1002/cyto.b.21023

Practical guidelines for the high‐sensitivity detection and monitoring of paroxysmal nocturnal hemoglobinuria clones by flow cytometry

2012· article· en· W2022699022 sur OpenAlexaff
D. Robert Sutherland, Michael Keeney, Andrea Illingworth

Notice bibliographique

RevueCytometry Part B Clinical Cytometry · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueComplement system in diseases
Établissements canadiensLondon Health Sciences CentreToronto General Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésParoxysmal nocturnal hemoglobinuriaFlow cytometryImmunologyMedicineHemoglobinuriaStopped flowHemolysis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Paroxysmal nocturnal hemoglobinuria (PNH) is a life-threatening disorder caused by an inability to make glyco-phosphatidyl-inositol (GPI) anchors. While flow cytometry is the method of choice to detect the loss of GPI-linked proteins, the development and validation of sensitive, standardized, methodologies have been hampered by the rarity of this disease and by technical difficulties in the accurate identification of PNH cells. METHODS: Guidelines for the diagnosis and monitoring of PNH by flow cytometry were recently published by the International Clinical Cytometry Society (ICCS). However, specific reagent cocktails, and associated detailed analytic strategies were not directly addressed therein. In this supporting document based on the ICCS guidelines, we provide concise practical protocols for the high-sensitivity detection of PNH RBCs and WBCs (both granulocytes and monocytes). RESULTS: The CD235aFITC/CD59PE assay described was capable of detecting as few as 20 Type III PNH RBCs per million cells. Frequencies of Type III PNH cells in 10 normal samples were in the 0-6 per million RBCs. The high-resolution granulocyte/neutrophil assays described in this study could detect PNH phenotypes consistently at a level of 0.01% sensitivity. Frequencies of PNH phenotypes in normal individuals were in the 0-10 per million granulocytes/neutrophils range. CONCLUSIONS: The careful screening and selection of specific antibody conjugates has allowed the development of reagent cocktails suitable for high-sensitivity flow cytometric detection of PNH RBCs and PNH WBCs. The reagent cocktails described herein can be used on a variety of clinical flow cytometers equipped with four or more photo multiplier tubes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,020
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,025
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,020
Score d'incertitude au seuil0,103

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0200,025
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0030,002
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0060,002
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0050,002
Intégrité de la recherche0,0050,004
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0120,023

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,172
Tête enseignante GPT0,441
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations137
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCytometry Part B Clinical CytometryMême sujetComplement system in diseasesTravaux en français237 207