Translation Mediated by the Internal Ribosome Entry Site of the cat-1 mRNA Is Regulated by Glucose Availability in a PERK Kinase-dependent Manner
Notice bibliographique
Résumé
The cationic amino acid transporter, Cat-1, is a high affinity transporter of the essential amino acids, arginine and lysine. Expression of the cat-1 gene is known to be regulated by amino acid availability. It is shown here that cat-1 gene expression is also induced by Glc limitation, which causes a 7-fold increase in cat-1 mRNA, a 30-fold induction of Cat-1 protein levels, and a 4-fold stimulation of arginine uptake. Glc limitation is known to induce the unfolded protein response (UPR) by altering protein glycosylation in the endoplasmic reticulum (ER). The studies here demonstrate that synthesis of Cat-1 occurs during the UPR when global protein synthesis is inhibited. The 5'-UTR of the cat-1 mRNA contains an internal ribosomal entry site (IRES) that is activated by amino acid starvation by a mechanism that involves phosphorylation of the translation initiation factor, eukaryotic initiation factor 2alpha, by the GCN2 kinase. It is shown here that translation from the cat-1/IRES is also induced by Glc deprivation in a manner dependent upon phosphorylation of eukaryotic initiation factor 2alpha by the transmembrane ER kinase, PERK. Because PERK is a key constituent of the UPR, it is concluded that induction of cat-1 gene expression is part of the adaptive response of cells to ER stress. These results also demonstrate that regulation of IRES activity in cellular mRNAs is part of the mechanism by which the UPR protects cells from unfolded proteins in the ER.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,003 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».