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Enregistrement W2023147995 · doi:10.1074/jbc.m412827200

Thermodynamic, Kinetic, and Electron Microscopy Studies of Concanavalin A and Dioclea grandiflora Lectin Cross-linked with Synthetic Divalent Carbohydrates

2005· article· en· W2023147995 sur OpenAlexaff
Tarun K. Dam, Stefan Oscarson, René Roy, Sanjoy K. Das, Daniel Pagé, Frank Macaluso, C. Fred Brewer

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueGalectins and Cancer Biology
Établissements canadiensUniversité du Québec à Montréal
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésLectinConcanavalin ADivalentChemistryBiochemistryStereochemistryOrganic chemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The jack bean lectin concanavalin A (ConA) and the Dioclea grandiflora lectin (DGL) are highly homologous Man/Glc-specific members of the Diocleinae subtribe. Both lectins bind, cross-link, and precipitate with carbohydrates possessing multiple terminal nonreducing Man residues. The present study investigates the binding and cross-linking interactions of ConA and DGL with a series of synthetic divalent carbohydrates that possess spacer groups with increasing flexibility and length between terminal alpha-mannopyranoside residues. Isothermal titration microcalorimetry was used to determine the thermodynamics of binding of the two lectins to the divalent analogs, and kinetic light scattering and electron microscopy studies were used to characterize the cross-linking interactions of the lectins with the carbohydrates. The results demonstrated that divalent analogs with flexible spacer groups between the two terminal Man residues possess higher affinities for the two lectins as compared with those with inflexible spacer groups. Furthermore, despite their high degree of homology, ConA and DGL exhibit differences in their kinetics of cross-linking and precipitation with the divalent analogs. Electron microscopy shows the loss of organized cross-linked lattices of the two lectins with analogs possessing increased distance between the terminal Man residues. The loss of lattice patterns with the analogs is distinct for each lectin. These results have important implications for the interactions of lectins with multivalent carbohydrate receptors in biological systems.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,043
Score d'incertitude au seuil0,469

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,277 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations71
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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