Identification of Residues in the Drug Translocation Pathway of the Human Multidrug Resistance P-glycoprotein by Arginine Mutagenesis
Notice bibliographique
Résumé
P-glycoprotein (P-gp, ATP-binding cassette B1) is a drug pump that extracts toxic drug substrates from the plasma membrane and catalyzes their ATP-dependent efflux. To map the residues in the drug translocation pathway, we performed arginine-scanning mutagenesis on all transmembrane (TM) segments (total = 237 residues) of a P-gp processing mutant (G251V) defective in folding (15% maturation efficiency) (glycosylation state used to monitor folding). The rationale was that arginines introduced into the drug-binding sites would mimic drug rescue and enhance maturation of wild-type or processing mutants of P-gp. It was found that 38 of the 89 mutants that matured had enhanced maturation. Enhancer mutations were found in 11 of the 12 TM segments with the largest number found in TMs 6 and 12 (seven in each), TMs that are critical for P-gp-drug substrate interactions. Modeling of the TM segments showed that the enhancer arginines were found on the hydrophilic face, whereas inhibitory arginines were located on a hydrophobic face that may be in contact with the lipid bilayer. It was found that many of the enhancer arginines caused large alterations in P-gp-drug interactions in ATPase assays. For example, mutants A302R (TM5), L339R (TM6), G872R (TM10), F942R (TM11), Q946R (TM11), V982R (TM12), and S993R (TM12) reduced the apparent affinity for verapamil by approximately 10-fold, whereas the F336R (TM6) and M986R (TM12) mutations caused at least a 10-fold increase in apparent affinity for rhodamine B. The results suggest that P-gp contains a large aqueous-filled drug translocation pathway with multiple drug-binding sites that can accommodate the bulky arginine side chains to promote folding of the protein.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».