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Enregistrement W2024429303 · doi:10.1016/j.ijid.2007.03.004

Molecular epidemiology of methicillin-resistant Staphylococcus aureus isolates from regional hospitals in Trinidad and Tobago

2007· article· en· W2024429303 sur OpenAlexaffabout
Patrick Eberechi Akpaka, Shivnarine Kissoon, Candy Rutherford, William H. Swanston, Padman Jayaratne

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Infectious Diseases · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAntimicrobial Resistance in Staphylococcus
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesFakultet Medicinskih Nauka, Univerziteta U Kragujevcu
Mots-clésPulsed-field gel electrophoresisMethicillin-resistant Staphylococcus aureusMolecular epidemiologyStaphylococcus aureusMultilocus sequence typingMicrobiologyGenotypeStaphylococcal infectionsMeticillinBiologyMedicineGeneGeneticsBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: Methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA), first reported in a British hospital in the early 1960s, has now reached global proportions. Geographic spread of one or several MRSA clones in a city, country, and even among countries and continents has been identified by molecular techniques. We sought to determine whether clonal spread of MRSA has occurred in Trinidad and Tobago from all MRSA isolates collected between 2000 and 2001. METHODS: Clinical isolates of MRSA from three major hospitals in Trinidad and Tobago were identified by standard laboratory methods and analyzed using multiplex polymerase chain reaction (PCR) and pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) after SmaI digestion. RESULTS: There was a 12.8% prevalence of MRSA in three major regional hospitals in Trinidad and Tobago. All 60 randomly selected MRSA strains from these hospitals produced similar PFGE banding patterns, suggesting a genetic relatedness among strains and that they belonged to a single clonal family. All isolates were negative for the Panton-Valentine leukocidin gene (pvl). These strains shared a PFGE banding pattern approximately (96%) the same as a Canadian strain called CMRSA-6 in the Canadian National Microbiology Laboratory database. CONCLUSIONS: We conclude that only one major PFGE genotype of MRSA clone is circulating among the three major regional hospitals in Trinidad and Tobago suggesting one of three possible scenarios of microevolution: (1) all were from the dissemination of a single epidemic MRSA clone prevailing in these hospitals in Trinidad and Tobago; or (2) MRSA in Trinidad and Tobago is evolving more slowly than in other countries; or (3) that if other MRSA clones have been present in Trinidad and Tobago, they have not persisted.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,063
Score d'incertitude au seuil0,713

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,322
Écart entre enseignants0,305 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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