Interconversion of (<i>S</i>)-Glutamate and (2<i>S</i>,3<i>S</i>)-3-Methylaspartate: A Distinctive B<sub>12</sub>-Dependent Carbon-Skeleton Rearrangement
Notice bibliographique
Résumé
The interconversion of (S)-glutamate and (2S,3S)-3-methylaspartate catalyzed by B(12)-dependent glutamate mutase is discussed using results from high-level ab initio molecular orbital calculations. Evidence is presented regarding the possible role of coenzyme-B(12) in substrate activation and product formation via radical generation. Calculated electron paramagnetic resonance parameters support experimental evidence for the involvement of substrate-derived radicals and will hopefully aid the future detection of other important radical intermediates. The height of the rearrangement barrier for a fragmentation-recombination pathway, calculated with a model that includes neutral amino and carboxylic acid substituents in the migrating glycyl group, supports recent experimental evidence for the interconversion of (S)-glutamate and (2S,3S)-3-methylaspartate through such a pathway. Our calculations suggest that the enzyme may facilitate the rearrangement of (S)-glutamate through (partial) proton-transfer processes that control the protonation state of substituents in the migrating group.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».