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Enregistrement W2025445118 · doi:10.1371/journal.pone.0003872

The POM Monoclonals: A Comprehensive Set of Antibodies to Non-Overlapping Prion Protein Epitopes

2008· article· en· W2025445118 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePrion Diseases and Protein Misfolding
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesEidgenössische Technische Hochschule ZürichAlberta Prion Research InstituteUniversität ZürichEuropean CommissionJavna Agencija za Raziskovalno Dejavnost RSSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungNational Science Foundation
Mots-clésEpitopeEpitope mappingMonoclonal antibodyAntibodyImmunoprecipitationAvidityParatopeMolecular biologyConformational epitopeChemistryVirologyBiologyImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PrP(Sc), a misfolded and aggregated form of the cellular prion protein PrP(C), is the only defined constituent of the transmissible agent causing prion diseases. Expression of PrP(C) in the host organism is necessary for prion replication and for prion neurotoxicity. Understanding prion diseases necessitates detailed structural insights into PrP(C) and PrP(Sc). Towards this goal, we have developed a comprehensive collection of monoclonal antibodies denoted POM1 to POM19 and directed against many different epitopes of mouse PrP(C). Three epitopes are located within the N-terminal octarepeat region, one is situated within the central unstructured region, and four epitopes are discontinuous within the globular C-proximal domain of PrP(C). Some of these antibodies recognize epitopes that are resilient to protease digestion in PrP(Sc). Other antibodies immunoprecipitate PrP(C), but not PrP(Sc). A third group was found to immunoprecipitate both PrP isoforms. Some of the latter antibodies could be blocked with epitope-mimicking peptides, and incubation with an excess of these peptides allowed for immunochromatography of PrP(C) and PrP(Sc). Amino-proximal antibodies were found to react with repetitive PrP(C) epitopes, thereby vastly increasing their avidity. We have also created functional single-chain miniantibodies from selected POMs, which retained the binding characteristics despite their low molecular mass. The POM collection, thus, represents a unique set of reagents allowing for studies with a variety of techniques, including western blotting, ELISA, immunoprecipitation, conformation-dependent immunoassays, and plasmon surface plasmon resonance-based assays.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,364

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,048
Tête enseignante GPT0,259
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle