Molecular characterization of<i>Fusarium oxysporum</i>f. sp.<i>cubense</i>race 1 and 4 isolates from Taiwan and Southern China
Notice bibliographique
Résumé
Fusarium wilt of banana (Musa spp.), caused by Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc), is one of the most important banana diseases. Three races (1, 2, 4) of Foc have been identified worldwide, but race 4 (especially tropical race 4, TR4) is the most destructive pathogen and has significant impacts on banana production in Taiwan and Southern China. To characterize the genetic relationship of Foc in these two regions, 55 isolates of Foc, including 18 from Taiwan and 37 from Hainan and Guangdong Provinces, were subjected to pathogenicity tests, race 4-specific polymerase chain reaction (PCR) diagnosis, and amplified fragment length polymorphism (AFLP) analysis. One race 4 isolate from Australia, one race 1 isolate from Philippines, and 10 non-banana F. oxysporum isolates were also included in the study for comparison. Pathogenicity tests indicated that 16 and 21 isolates of Foc from Taiwan and Southern China, respectively, were pathogenic on Cavendish banana and classified as race 4, and the remaining isolates were identified as race 1. PCR amplification with race 4 and tropical race 4-specific primers confirmed that all of the race 4 isolates from Taiwan and Southern China were TR4. AFLP analysis with eight EcoRI-MseI primer combinations clustered the 67 F. oxysporum isolates analyzed into two major groups, one containing all race 4 isolates and the other consisting of race 1 isolates along with the non-banana F. oxysporum isolates. No significant divergence was observed among TR4 isolates from Southern China and Taiwan, suggesting that the TR4 isolates from Southern China might share the same lineage as those from Taiwan.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».