Molecular data resolve placement of the Olympic marmot and estimate dates of trans-Beringian interchange
Notice bibliographique
Résumé
We reinvestigated the phylogeny of all 15 species of Marmota to resolve a conflict between 2 published analyses, one by Kruckenhauser et al. and another by Steppan et al., regarding the Olympic marmot (M. olympus) and to improve resolution in the genus. We acquired fresh samples of M. olympus, combined all available data on mitochondrial DNA (cytochrome b [Cytb] and ND3/ND4), new sequences for ND3/ND4, and 2,000 base pairs (bp) of the nuclear RAG1 gene. All analyses indicate that M. olympus is a much older, rather than more recent, offshoot of the widespread hoary marmot (M. caligata) or Vancouver Island marmot (M. vancouverensis). The mitochondrial data and some RAG1 results are largely congruent, but RAG1 differs on several points, including: the subgenus Marmota appears paraphyletic to Petromarmota, with reciprocally monophyletic Palearctic and Nearctic clades; and the long-tailed marmot (M. caudata) and Menzbier's marmot (M. menzbieri) are not sister species, suggesting mitochondrial introgression. Asia was colonized by Marmota from North America at approximately 4.6 million years ago (mya), followed by rapid diversification of several major lineages. M. olympus diverged from the M. caligata-M. vancouverensis lineage at approximately 2.6 mya, whereas M. vancouverensis and M. caligata diverged at only about 0.4–1.2 mya. M. olympus might have survived in isolation on the Olympic Peninsula in a nunatak refugium throughout a series of glacial maxima.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».