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Enregistrement W2025721312 · doi:10.1111/jph.12038

Differential Expression of Potato Defence Genes Associated with the Salicylic Acid Defence Signalling Pathway in Response to Weakly and Highly Aggressive Isolates of <i>Verticillium dahliae</i>

2012· article· en· W2025721312 sur OpenAlexafffund
Holly Derksen, Mohamed Badawi, María Antonia Henríquez, Zhen Yao, Ahmed F. El‐Bebany, Fouad Daayf

Notice bibliographique

RevueJournal of Phytopathology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensUniversity of Manitoba
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésVerticillium dahliaeBiologyVerticillium wiltCultivarSalicylic acidGene expressionGeneInoculationBotanyPlant disease resistanceHorticultureGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Verticillium wilt is a vascular disease affecting hundreds of important dicotyledonous crops worldwide. Its main causal agent in potato is Verticillium dahliae Kleb. A differential potato‐V. dahliae system consisting of two cultivars of potato (susceptible; S and moderately resistant; MR) and two V. dahliae isolates (weakly, WA and highly aggressive, HA), was used to evaluate the expression of five defence‐related genes, PAL1, PAL2, PR‐1, PR‐2 and PR‐5. These genes were selected because they are in general associated with the salicylic acid defence signalling pathway. Expression levels of these genes were assessed in potato roots and leaves at 0, 4 and 21 h (hpi), and 3, 7 and 14 days postinoculation (dpi). In the roots, the expression of PAL1, PR‐1 and PR‐2 in the MR was higher than in the susceptible cultivar in response to inoculation with either one of the tested V. dahliae isolates. PAL2 gene expression increased gradually starting at 21 hpi in the MR cultivar as opposed to the susceptible one. Higher expression of PR‐1 was detected at 7 dpi in roots. In the leaves, both PAL1 and PAL2 genes showed higher expression in the MR cultivar relative to the susceptible one. Interestingly, the expression of PR‐2 was slightly higher in the susceptible cultivar. Combined data analyses revealed that PAL1, PAL2, PR‐1 and PR‐2 genes are regulated at the transcriptional level in response to infection by V. dahliae. These results indicate that the salicylic acid pathway is also involved in potato defence against V. dahliae and add to the data gathered to elucidate the signalling mechanisms in this host–pathogen interaction.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,222
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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